今から約25年前───五十嵐兄妹が生まれる前の物語。科学研究組織・ノアに、瀕死の重傷を負った1人の男が運び込まれた。その男──白波純平は狩崎真澄によってギフの細胞を心臓に移植され、一命を取り留めた。そして最強の悪魔ハンターとなることを強制され、ベイルドライバーを渡される。赤い悪魔に両親を殺された純平は、復讐心を胸に仮面ライダーベイルとなり、悪魔と戦い続けるが───。